微生物無處不在。它們雖然不被肉眼所見，卻富含在空氣、土壤、及水中。我們的皮膚和頭發上、口腔、腸道和陰道里都有微生物的存在。微生物包括：細菌、病毒、真菌以及一些小型的原生生物、顯微藻類等在內的一大類生物群體，它們個體微小，與人類關系密切。
女性陰道的微生物多達200多種，包括：腸球菌、鏈球菌、雙歧桿菌、擬桿菌、表皮葡萄球菌等，以及除了細菌以外的原蟲、支原體等。這些微生物主要寄居于陰道四周的側壁黏膜上。它們之間相互制約、相互作用，有層次、有秩序地定植于陰道內，共同形成了陰道的微生物群。
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